MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 47602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007520	ACA	2	6	4	9	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484347
2	NC_007520	AGA	3	9	96	104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484347
3	NC_007520	A	6	6	157	162	100 %	0 %	0 %	0 %	78484347
4	NC_007520	TCAAA	2	10	171	180	60 %	20 %	0 %	20 %	78484347
5	NC_007520	TGG	2	6	194	199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484347
6	NC_007520	GCC	2	6	319	324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484347
7	NC_007520	A	6	6	352	357	100 %	0 %	0 %	0 %	78484347
8	NC_007520	TCC	2	6	366	371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78484347
9	NC_007520	A	7	7	373	379	100 %	0 %	0 %	0 %	78484347
10	NC_007520	GAAGG	2	10	427	436	40 %	0 %	60 %	0 %	78484347
11	NC_007520	GCG	2	6	448	453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484347
12	NC_007520	CGGCA	2	10	458	467	20 %	0 %	40 %	40 %	78484347
13	NC_007520	TGG	2	6	483	488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484347
14	NC_007520	CTTT	2	8	500	507	0 %	75 %	0 %	25 %	78484347
15	NC_007520	GGC	2	6	514	519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484347
16	NC_007520	GAAT	2	8	558	565	50 %	25 %	25 %	0 %	78484347
17	NC_007520	GTG	2	6	592	597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484347
18	NC_007520	TTCA	2	8	602	609	25 %	50 %	0 %	25 %	78484347
19	NC_007520	TGA	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484347
20	NC_007520	GTT	2	6	693	698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484347
21	NC_007520	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484347
22	NC_007520	A	6	6	724	729	100 %	0 %	0 %	0 %	78484347
23	NC_007520	AAG	2	6	740	745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484347
24	NC_007520	TTC	2	6	748	753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484347
25	NC_007520	GGAA	2	8	774	781	50 %	0 %	50 %	0 %	78484347
26	NC_007520	TGGA	2	8	824	831	25 %	25 %	50 %	0 %	78484347
27	NC_007520	ACC	2	6	885	890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484347
28	NC_007520	GGC	2	6	927	932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484347
29	NC_007520	CAA	2	6	1051	1056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484347
30	NC_007520	CAA	2	6	1108	1113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484347
31	NC_007520	A	6	6	1112	1117	100 %	0 %	0 %	0 %	78484347
32	NC_007520	A	6	6	1139	1144	100 %	0 %	0 %	0 %	78484347
33	NC_007520	ATT	2	6	1154	1159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484347
34	NC_007520	AGA	2	6	1192	1197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484347
35	NC_007520	ACG	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484347
36	NC_007520	ATC	2	6	1352	1357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484347
37	NC_007520	GAA	2	6	1363	1368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484347
38	NC_007520	ATT	2	6	1390	1395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484347
39	NC_007520	AATT	2	8	1399	1406	50 %	50 %	0 %	0 %	78484347
40	NC_007520	GTTC	2	8	1415	1422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007520	ATTT	2	8	1471	1478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007520	A	6	6	1554	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007520	TTACC	2	10	1782	1791	20 %	40 %	0 %	40 %	78484348
44	NC_007520	GTTC	2	8	1814	1821	0 %	50 %	25 %	25 %	78484348
45	NC_007520	GACT	2	8	1833	1840	25 %	25 %	25 %	25 %	78484348
46	NC_007520	TGA	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484348
47	NC_007520	GAT	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484348
48	NC_007520	GCCA	2	8	2018	2025	25 %	0 %	25 %	50 %	78484348
49	NC_007520	TGT	2	6	2052	2057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484348
50	NC_007520	ATTG	2	8	2197	2204	25 %	50 %	25 %	0 %	78484348
51	NC_007520	TGA	3	9	2206	2214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484348
52	NC_007520	TC	3	6	2229	2234	0 %	50 %	0 %	50 %	78484348
53	NC_007520	GAA	2	6	2264	2269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484348
54	NC_007520	ACCG	2	8	2354	2361	25 %	0 %	25 %	50 %	78484348
55	NC_007520	TTG	2	6	2378	2383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484348
56	NC_007520	GCG	2	6	2390	2395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484348
57	NC_007520	GATT	2	8	2503	2510	25 %	50 %	25 %	0 %	78484348
58	NC_007520	ACT	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484348
59	NC_007520	GAA	2	6	2579	2584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484348
60	NC_007520	CAG	2	6	2614	2619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484348
61	NC_007520	TCA	2	6	2664	2669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484348
62	NC_007520	ACA	2	6	2811	2816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484349
63	NC_007520	TGC	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484349
64	NC_007520	CCA	2	6	2958	2963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484349
65	NC_007520	GAA	2	6	3160	3165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484349
66	NC_007520	CAT	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484349
67	NC_007520	TCAT	2	8	3224	3231	25 %	50 %	0 %	25 %	78484349
68	NC_007520	A	7	7	3280	3286	100 %	0 %	0 %	0 %	78484349
69	NC_007520	TGG	2	6	3326	3331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484349
70	NC_007520	CGC	2	6	3333	3338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484349
71	NC_007520	A	6	6	3341	3346	100 %	0 %	0 %	0 %	78484349
72	NC_007520	CTGG	2	8	3455	3462	0 %	25 %	50 %	25 %	78484349
73	NC_007520	AAG	2	6	3581	3586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484349
74	NC_007520	CAA	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484349
75	NC_007520	TTA	2	6	3637	3642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484349
76	NC_007520	GCAA	2	8	3645	3652	50 %	0 %	25 %	25 %	78484349
77	NC_007520	TTGA	2	8	3691	3698	25 %	50 %	25 %	0 %	78484349
78	NC_007520	AGC	2	6	3863	3868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484349
79	NC_007520	GAA	2	6	3909	3914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007520	A	8	8	4029	4036	100 %	0 %	0 %	0 %	78484350
81	NC_007520	TCG	2	6	4057	4062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484350
82	NC_007520	ATT	2	6	4122	4127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484350
83	NC_007520	A	6	6	4146	4151	100 %	0 %	0 %	0 %	78484350
84	NC_007520	A	7	7	4253	4259	100 %	0 %	0 %	0 %	78484350
85	NC_007520	CGA	2	6	4265	4270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484350
86	NC_007520	ACG	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484350
87	NC_007520	AT	3	6	4577	4582	50 %	50 %	0 %	0 %	78484350
88	NC_007520	GA	3	6	4633	4638	50 %	0 %	50 %	0 %	78484350
89	NC_007520	CTT	2	6	4639	4644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484350
90	NC_007520	CT	4	8	4679	4686	0 %	50 %	0 %	50 %	78484351
91	NC_007520	TGG	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484351
92	NC_007520	CAC	2	6	4739	4744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484351
93	NC_007520	CTGA	2	8	4745	4752	25 %	25 %	25 %	25 %	78484351
94	NC_007520	TCA	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484351
95	NC_007520	CGTT	2	8	4931	4938	0 %	50 %	25 %	25 %	78484351
96	NC_007520	TCG	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484351
97	NC_007520	CAA	3	9	5048	5056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484351
98	NC_007520	AACG	2	8	5097	5104	50 %	0 %	25 %	25 %	78484351
99	NC_007520	TGA	2	6	5142	5147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484351
100	NC_007520	TTACT	2	10	5156	5165	20 %	60 %	0 %	20 %	78484351
101	NC_007520	A	6	6	5172	5177	100 %	0 %	0 %	0 %	78484351
102	NC_007520	AAC	2	6	5199	5204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484351
103	NC_007520	TGGAAG	2	12	5259	5270	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	78484351
104	NC_007520	GCCA	2	8	5327	5334	25 %	0 %	25 %	50 %	78484351
105	NC_007520	GCA	2	6	5341	5346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484351
106	NC_007520	TTG	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484351
107	NC_007520	GAT	2	6	5417	5422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484351
108	NC_007520	ACA	2	6	5464	5469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484351
109	NC_007520	A	7	7	5474	5480	100 %	0 %	0 %	0 %	78484351
110	NC_007520	A	6	6	5507	5512	100 %	0 %	0 %	0 %	78484351
111	NC_007520	CAA	2	6	5591	5596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484351
112	NC_007520	CTTCAC	2	12	5615	5626	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	78484351
113	NC_007520	TTG	2	6	5693	5698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484351
114	NC_007520	GCCA	2	8	5769	5776	25 %	0 %	25 %	50 %	78484351
115	NC_007520	GCA	2	6	5902	5907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484351
116	NC_007520	AGG	2	6	5956	5961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78484351
117	NC_007520	TCC	2	6	5990	5995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_007520	A	6	6	6002	6007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007520	TGG	2	6	6018	6023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007520	T	6	6	6035	6040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007520	TCAA	2	8	6079	6086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007520	ACTT	2	8	6172	6179	25 %	50 %	0 %	25 %	78484352
123	NC_007520	CAAAC	2	10	6244	6253	60 %	0 %	0 %	40 %	78484352
124	NC_007520	CGC	2	6	6254	6259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484352
125	NC_007520	CAG	2	6	6386	6391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484352
126	NC_007520	CAA	2	6	6396	6401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
127	NC_007520	ACA	2	6	6440	6445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
128	NC_007520	AAC	2	6	6466	6471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
129	NC_007520	CAAA	2	8	6489	6496	75 %	0 %	0 %	25 %	78484352
130	NC_007520	A	7	7	6494	6500	100 %	0 %	0 %	0 %	78484352
131	NC_007520	AGTC	2	8	6506	6513	25 %	25 %	25 %	25 %	78484352
132	NC_007520	AAAC	2	8	6537	6544	75 %	0 %	0 %	25 %	78484352
133	NC_007520	ATTTG	2	10	6599	6608	20 %	60 %	20 %	0 %	78484352
134	NC_007520	A	7	7	6640	6646	100 %	0 %	0 %	0 %	78484352
135	NC_007520	AGAA	2	8	6655	6662	75 %	0 %	25 %	0 %	78484352
136	NC_007520	AGC	2	6	6766	6771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484352
137	NC_007520	ATG	2	6	6786	6791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484352
138	NC_007520	AAC	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
139	NC_007520	ACA	2	6	7025	7030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
140	NC_007520	AAG	2	6	7057	7062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484352
141	NC_007520	CT	3	6	7092	7097	0 %	50 %	0 %	50 %	78484352
142	NC_007520	CAA	2	6	7101	7106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
143	NC_007520	GAA	2	6	7119	7124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484352
144	NC_007520	CTG	2	6	7182	7187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484352
145	NC_007520	ACA	2	6	7193	7198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
146	NC_007520	TAAAT	2	10	7211	7220	60 %	40 %	0 %	0 %	78484352
147	NC_007520	ACCC	2	8	7305	7312	25 %	0 %	0 %	75 %	78484353
148	NC_007520	CCTTT	2	10	7319	7328	0 %	60 %	0 %	40 %	78484353
149	NC_007520	TGA	2	6	7353	7358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484353
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151	NC_007520	TCT	2	6	7451	7456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484353
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153	NC_007520	T	6	6	7630	7635	0 %	100 %	0 %	0 %	78484353
154	NC_007520	A	6	6	7718	7723	100 %	0 %	0 %	0 %	78484353
155	NC_007520	CAA	2	6	7757	7762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484353
156	NC_007520	CAT	2	6	7855	7860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484353
157	NC_007520	TCAAA	2	10	7861	7870	60 %	20 %	0 %	20 %	78484353
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162	NC_007520	AGC	2	6	8181	8186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484353
163	NC_007520	CGCGA	2	10	8216	8225	20 %	0 %	40 %	40 %	78484353
164	NC_007520	ACA	2	6	8235	8240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484353
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166	NC_007520	GTT	2	6	8282	8287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484353
167	NC_007520	TTC	2	6	8324	8329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484353
168	NC_007520	CAG	2	6	8371	8376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484353
169	NC_007520	AAT	2	6	8424	8429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484353
170	NC_007520	GATT	2	8	8437	8444	25 %	50 %	25 %	0 %	78484354
171	NC_007520	TTG	2	6	8478	8483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484354
172	NC_007520	GGT	2	6	8502	8507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484354
173	NC_007520	A	6	6	8521	8526	100 %	0 %	0 %	0 %	78484354
174	NC_007520	ATC	2	6	8571	8576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484354
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176	NC_007520	TCA	2	6	8620	8625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484354
177	NC_007520	AGTC	2	8	8663	8670	25 %	25 %	25 %	25 %	78484354
178	NC_007520	CGTT	2	8	8673	8680	0 %	50 %	25 %	25 %	78484354
179	NC_007520	TGCCAT	2	12	8690	8701	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78484354
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232	NC_007520	TTTC	2	8	11619	11626	0 %	75 %	0 %	25 %	78484355
233	NC_007520	GCT	2	6	11629	11634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484355
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238	NC_007520	GCC	2	6	11855	11860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
239	NC_007520	CGT	2	6	11991	11996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484356
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249	NC_007520	CCA	2	6	12508	12513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484356
250	NC_007520	AGTTT	2	10	12526	12535	20 %	60 %	20 %	0 %	78484356
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252	NC_007520	TTGA	2	8	12703	12710	25 %	50 %	25 %	0 %	78484357
253	NC_007520	A	6	6	12721	12726	100 %	0 %	0 %	0 %	78484357
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262	NC_007520	CA	3	6	13108	13113	50 %	0 %	0 %	50 %	78484357
263	NC_007520	A	6	6	13215	13220	100 %	0 %	0 %	0 %	78484357
264	NC_007520	TGA	2	6	13224	13229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484357
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266	NC_007520	AAT	2	6	13240	13245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484357
267	NC_007520	ACA	2	6	13271	13276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484357
268	NC_007520	ATCA	2	8	13291	13298	50 %	25 %	0 %	25 %	78484357
269	NC_007520	ACA	2	6	13305	13310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484357
270	NC_007520	TGC	2	6	13328	13333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484357
271	NC_007520	CGC	2	6	13377	13382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484357
272	NC_007520	GACC	2	8	13437	13444	25 %	0 %	25 %	50 %	78484357
273	NC_007520	A	6	6	13692	13697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_007520	A	6	6	13860	13865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_007520	T	7	7	25019	25025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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